El plan curricular del Doctorado en Ciencias de la Computación está distribuido en 8 semestres y se basa en la siguiente estructura:

• Eje básico. Este eje está formado por la materia de Teoría de la Computación con la finalidad de proporcionar al alumno los principios teóricos necesarios para comprender, analizar y aplicar modelos matemáticos en la resolución de problemas prácticos en el Doctorado en Ciencias de la Computación.
• Eje de especialización. Formado por las materias disciplinarias: Optativa I, Optativa II y Optativa III, creadas para fortalecer los proyectos de acuerdo de investigación a las LGAC.
• Eje de investigación. En este eje se plantean cinco seminarios de investigación dedicados a la escritura del protocolo,
  elaboración de un artículo para revista indexada, además de tres materias: proyecto de tesis I, proyecto de tesis II y proyecto de tesis III para dar seguimiento a los alumnos en el avance de su proyecto de investigación y la escritura de la tesis.

Lista de materias ofertadas.